多營業所營業稅申報與總繳作業說明

本頁摘要

說明多據點、多統一編號（統編）之營業人，如何搭配 e首發票 匯整發票資料，並與營業稅離線申報軟體銜接，完成各據點申報或總機構總繳之建議作業分工與順序。實際可否總繳、申報表格式與送件方式，以稅捐稽徵機關核定及現行法令為準。

1. 適用對象

本說明適合符合下列情境之營業人參考（不限定產業別）：

組織內有多個營業場所或分公司，且可能對應多個統編。
發票資料由 e首發票（含與貴公司 ERP 或訂單系統整合之情境）集中或分據點管理。
營業稅申報須使用主管機關提供之離線申報軟體（或同等申報管道），並產製規定之媒體檔與申報書表。

2. 名詞說明

用語	說明
申報主體	依法須辦理營業稅申報者，通常為一統編一申報單位（實際以稅籍為準）。
營業所／分據點	實際營運或開立發票之場所；是否為獨立申報主體，依稅籍登記判定。
總機構	辦理總繳時之彙總申報單位；資格與範圍須經稽徵機關核定。
總繳	合於法令規定時，由總機構彙總申報之方式；非所有多據點組織均適用。
媒體檔	依離線申報軟體要求匯入之進項、銷項等電子格式檔案。
離線申報軟體	用於營業稅申報之離線作業程式（版本與操作以主管機關公告及軟體說明為準）。

3. 系統分工（概念）

層次	建議角色
e首發票	匯總電子發票開立、取號、上傳與查詢；可依專案設定輸出申報用資料或檔案（實際欄位與格式以貴公司上線範圍與顧問確認為準）。
貴公司 ERP／進銷存	非發票憑證（例如部分進口、成本分攤欄位）可能仍須由此補齊或勾稽。
離線申報軟體	匯入媒體、試算、檢核錯誤、產製申報書表與送件檔（若該期適用）。

4. 總機構與各據點：兩種常見分工

實務上須先向稽徵機關或稅務顧問確認貴公司屬於哪一種（或混合）模式，再固化內部 SOP。

4.1 各據點各自申報

每一申報主體（統編）自行準備當期進銷項資料。
e首發票依統編或據點範圍輸出（或供下載）申報用資料。
各據點承辦於離線申報軟體完成匯入、檢核與申報。

4.2 總機構總繳

由總機構依核定範圍彙總各成員資料（實務上可能是「先由各據點產出媒體再上傳／合併」，或「由總機構一次從系統匯出全公司」，依貴公司內規與顧問建議）。
e首發票需支援多統編／多據點之權限與報表範圍（以合約與建置規格為準）。
總機構承辦於離線申報軟體走總繳相關流程（選單與步驟以上線之申報軟體手冊為準）。

4.3 與「單一公司、單一統編」申報之差異（概念）

面向	單一統編（常見）	多統編＋總繳（常見顧問架構）
申報書	通常一份申報書對應一統編當期資料	各分據點仍可能各自產申報書並上傳；總機構另可能須登錄兩份申報書（本機構與彙總報繳），以核定與手冊為準
稅款	自行於離線軟體完成繳稅方式登錄並繳納	分據點可能不負責繳納本期稅款；僅總機構統一繳納，以核定為準
全集團數字	不適用	若未申請進銷項併總公司合併申報，總機構離線軟體內未必存有各分據點發票明細，通常無法只靠離線軟體自動加總全集團進銷；宜由 ERP／e首發票先做彙總勾稽後，再登錄或匯入申報書
申報書媒體檔	依當期規範	除進銷項媒體外，可能另有零稅率清單、直抵附表、申報書媒體等（格式以主管機關公告與軟體說明為準）

5. 建議作業流程（總覽）

flowchart TB
  subgraph prep [準備]
    A[確認申報屬期與各統編稅籍身分]
    B[e首發票與 ERP 資料就緒]
    A --> B
  end
  subgraph media [媒體與資料]
    C[產製或匯出進項／銷項等媒體]
    D[補齊非發票憑證與特殊申報資料]
    B --> C --> D
  end
  subgraph declare [離線申報軟體]
    E[匯入媒體並執行檢核]
    F[修正錯誤或回補來源資料]
    G[產製申報書表與送件]
    D --> E --> F --> G
  end
  subgraph arch [完成]
    H[歸檔申報書表與工作紀錄]
    G --> H
  end

5.1 媒體檔格式（概念｜須以主管機關最新公告為準）

實務上離線申報常搭配固定長度之純文字檔，檔名慣例含統一編號。下列為實務顧問常引用之結構概念（非法律條文；位元組數與代號須以當期申報軟體規格為準）：

慣例檔名	常見用途（概念）
`統編.TXT`	進項、銷項等憑證媒體（含部分進口繳納證類型）
`統編.T02`	零稅率銷售額相關清單
`統編.T01`	直接扣抵法附表一（進項依專供應稅／專供免稅／共同等用途區分）
`統編.TET_U`	申報書媒體；總繳情境下總機構檔案可能對應多份申報書邏輯，以軟體與顧問指引為準

e首發票與貴公司 ERP 之客製重點，通常在於：能否依統編穩定產出上述檔案、欄位與會計分類一致，並支援全集團彙總報表供總機構與離線軟體勾稽。

6. 常見申報資料類型（與發票之關係）

下列為多營業所環境下常見須納入申報規劃之項目；細目、格式與離線軟體選單請以申報軟體說明與法令為準。

類型	概要
進項	憑證扣抵資料；若含進口情形，常需搭配關務或帳上進口稅費資料另行匯入或登錄。
銷項	銷售額與稅額；若有出口或零稅率銷售，多需額外清單或欄位區隔。
零稅率銷售額清單	與零稅率、外銷相關之明細或彙總（依規定格式）。
直抵與共同（進項）	進項費用屬專屬可直抵或須共同分攤者，影響扣抵與申報欄位（依會計與稅法處理）。

補充（觀念）：發票上之銷項稅別（應稅、零稅率、免稅、混稅等）描述的是該筆銷售之課稅屬性；直接扣抵法對進項之用途分類（例如專供應稅、專供免稅、共同使用）則是買方對成本費用之歸屬，兩者為不同維度，系統設計時不宜混用。兼營情境下，共同進項之可扣抵比例常須參考當期銷售淨額結構計算（以申報書及顧問指引為準）。

7. 內部角色分工（建議）

角色	建議職責
各據點財稅承辦	確認該統編當期發票與憑證完整性、執行或配合產製媒體、初核金額。
總機構財稅承辦	總繳時程、成員清單、彙總勾稽、最終申報與歸檔。
資訊／系統管理	e首發票權限、統編範圍、匯出排程與檔案交握；離線申報軟體安裝與版本。
稅務顧問	稅籍、總繳資格、欄位解讀與法令異動說明。

8. 注意事項

法令與核定優先：本說明僅為作業分工參考，不構成稅務法律意見。
一統編一策略：同一集團內不同統編，申報責任與時程可能不同，不可假設均可由總機構代為一切操作。
版本一致：離線申報軟體與媒體格式須與當期公告相容；升級前建議於測試環境演練。
勾稽留痕：建議保留「系統匯出紀錄 → 媒體檔 → 申報書表」之對應關係，以利事後查核。

版本紀錄

版本	日期	修改者	修改內容
v1.2	2026-03-26	產品文件	§6 補充：銷項稅別與直抵進項用途為不同維度；共同進項與銷售淨額結構之關係（觀念）。
v1.1	2026-03-26	產品文件	新增與單一統編申報之差異、媒體檔概念表（TXT／T01／T02／TET_U）；ERP 彙總與離線軟體邊界說明。
v1.0	2026-03-26	產品文件	初版：多營業所與總繳之作業分工與流程總覽（對外、無特定客戶名稱）。